Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CipcQ8R0W1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CipcQ8R0W1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CipcQ8R0W1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CipcQ8R0W1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CipcQ8R0W1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CipcQ8R0W1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.3 ms