Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brd3Q8K2F0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brd3Q8K2F0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brd3Q8K2F0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brd3Q8K2F0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brd3Q8K2F0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brd3Q8K2F0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brd3Q8K2F0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brd3Q8K2F0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brd3Q8K2F0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brd3Q8K2F0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brd3Q8K2F0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd3Q8K2F0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd3Q8K2F0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brd3Q8K2F0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brd3Q8K2F0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brd3Q8K2F0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brd3Q8K2F0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Brd3Q8K2F0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brd3Q8K2F0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms