Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkd3Q8K1Y2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkd3Q8K1Y2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkd3Q8K1Y2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkd3Q8K1Y2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkd3Q8K1Y2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkd3Q8K1Y2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkd3Q8K1Y2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkd3Q8K1Y2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkd3Q8K1Y2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkd3Q8K1Y2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms