Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfwd3Q8CIK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfwd3Q8CIK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfwd3Q8CIK8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfwd3Q8CIK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfwd3Q8CIK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfwd3Q8CIK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfwd3Q8CIK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfwd3Q8CIK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfwd3Q8CIK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfwd3Q8CIK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfwd3Q8CIK8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfwd3Q8CIK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfwd3Q8CIK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfwd3Q8CIK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfwd3Q8CIK8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms