Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramef8Q8CE24 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pramef8Q8CE24 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pramef8Q8CE24 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pramef8Q8CE24 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef8Q8CE24 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef8Q8CE24 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef8Q8CE24 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef8Q8CE24 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef8Q8CE24 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef8Q8CE24 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef8Q8CE24 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms