Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lancl3Q8CD19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lancl3Q8CD19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lancl3Q8CD19 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lancl3Q8CD19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lancl3Q8CD19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lancl3Q8CD19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lancl3Q8CD19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lancl3Q8CD19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lancl3Q8CD19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lancl3Q8CD19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lancl3Q8CD19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lancl3Q8CD19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lancl3Q8CD19 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lancl3Q8CD19 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lancl3Q8CD19 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lancl3Q8CD19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lancl3Q8CD19 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lancl3Q8CD19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lancl3Q8CD19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lancl3Q8CD19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms