Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4bQ8C6J9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4bQ8C6J9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp4bQ8C6J9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp4bQ8C6J9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp4bQ8C6J9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp4bQ8C6J9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp4bQ8C6J9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp4bQ8C6J9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp4bQ8C6J9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms