Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sfrp1Q8C4U3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfrp1Q8C4U3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfrp1Q8C4U3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sfrp1Q8C4U3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sfrp1Q8C4U3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sfrp1Q8C4U3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms