Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpcpd1Q8C0L9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpcpd1Q8C0L9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpcpd1Q8C0L9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpcpd1Q8C0L9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gpcpd1Q8C0L9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpcpd1Q8C0L9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpcpd1Q8C0L9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gpcpd1Q8C0L9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpcpd1Q8C0L9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpcpd1Q8C0L9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpcpd1Q8C0L9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpcpd1Q8C0L9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpcpd1Q8C0L9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpcpd1Q8C0L9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpcpd1Q8C0L9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms