Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdh12Q8BYK4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh12Q8BYK4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh12Q8BYK4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh12Q8BYK4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rdh12Q8BYK4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh12Q8BYK4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms