Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iffo1Q8BXL9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iffo1Q8BXL9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Iffo1Q8BXL9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Iffo1Q8BXL9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Iffo1Q8BXL9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Iffo1Q8BXL9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Iffo1Q8BXL9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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