Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcl3Q8BVF2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcl3Q8BVF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcl3Q8BVF2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcl3Q8BVF2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcl3Q8BVF2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcl3Q8BVF2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Pdcl3Q8BVF2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcl3Q8BVF2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdcl3Q8BVF2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdcl3Q8BVF2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdcl3Q8BVF2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms