Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E330017A01RikQ8BU47 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E330017A01RikQ8BU47 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E330017A01RikQ8BU47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E330017A01RikQ8BU47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E330017A01RikQ8BU47 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E330017A01RikQ8BU47 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
E330017A01RikQ8BU47 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E330017A01RikQ8BU47 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms