Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smoc1Q8BLY1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smoc1Q8BLY1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smoc1Q8BLY1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smoc1Q8BLY1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smoc1Q8BLY1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smoc1Q8BLY1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smoc1Q8BLY1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smoc1Q8BLY1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smoc1Q8BLY1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smoc1Q8BLY1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smoc1Q8BLY1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smoc1Q8BLY1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms