Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmd3Q8BHD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmd3Q8BHD4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmd3Q8BHD4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd3Q8BHD4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd3Q8BHD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmd3Q8BHD4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd3Q8BHD4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd3Q8BHD4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd3Q8BHD4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd3Q8BHD4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms