Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AW551984Q8BGF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AW551984Q8BGF0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AW551984Q8BGF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AW551984Q8BGF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AW551984Q8BGF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AW551984Q8BGF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW551984Q8BGF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW551984Q8BGF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AW551984Q8BGF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AW551984Q8BGF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AW551984Q8BGF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AW551984Q8BGF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AW551984Q8BGF0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AW551984Q8BGF0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AW551984Q8BGF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AW551984Q8BGF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms