Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG34

Ubxn10, UBX domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn10Q8BG34 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ubxn10Q8BG34 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ubxn10Q8BG34 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ubxn10Q8BG34 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ubxn10Q8BG34 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn10Q8BG34 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn10Q8BG34 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubxn10Q8BG34 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubxn10Q8BG34 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ubxn10Q8BG34 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubxn10Q8BG34 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubxn10Q8BG34 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ubxn10Q8BG34 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubxn10Q8BG34 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ubxn10Q8BG34 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ubxn10Q8BG34 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ubxn10Q8BG34 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ubxn10Q8BG34 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubxn10Q8BG34 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubxn10Q8BG34 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms