Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZP0

4930503B20Rik, 4930503B20Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930503B20RikQ80ZP0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930503B20RikQ80ZP0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930503B20RikQ80ZP0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930503B20RikQ80ZP0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930503B20RikQ80ZP0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930503B20RikQ80ZP0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930503B20RikQ80ZP0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930503B20RikQ80ZP0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930503B20RikQ80ZP0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930503B20RikQ80ZP0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930503B20RikQ80ZP0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930503B20RikQ80ZP0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930503B20RikQ80ZP0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930503B20RikQ80ZP0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930503B20RikQ80ZP0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930503B20RikQ80ZP0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930503B20RikQ80ZP0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930503B20RikQ80ZP0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms