Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc1Q80VQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc1Q80VQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc1Q80VQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc1Q80VQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc1Q80VQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc1Q80VQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms