Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Avl9Q80U56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Avl9Q80U56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Avl9Q80U56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Avl9Q80U56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Avl9Q80U56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms