Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsg1bQ7TSF1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1bQ7TSF1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1bQ7TSF1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1bQ7TSF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1bQ7TSF1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1bQ7TSF1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dsg1bQ7TSF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1bQ7TSF1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dsg1bQ7TSF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dsg1bQ7TSF1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg1bQ7TSF1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dsg1bQ7TSF1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dsg1bQ7TSF1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dsg1bQ7TSF1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dsg1bQ7TSF1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dsg1bQ7TSF1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dsg1bQ7TSF1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms