Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcl2Q78Y63 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcl2Q78Y63 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcl2Q78Y63 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcl2Q78Y63 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcl2Q78Y63 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms