Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GypcQ78HU7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GypcQ78HU7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GypcQ78HU7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GypcQ78HU7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GypcQ78HU7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GypcQ78HU7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GypcQ78HU7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GypcQ78HU7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms