Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWM4

Lsm8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm8Q6ZWM4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lsm8Q6ZWM4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lsm8Q6ZWM4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lsm8Q6ZWM4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lsm8Q6ZWM4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lsm8Q6ZWM4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lsm8Q6ZWM4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lsm8Q6ZWM4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lsm8Q6ZWM4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lsm8Q6ZWM4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lsm8Q6ZWM4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lsm8Q6ZWM4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsm8Q6ZWM4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms