Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chsy1Q6ZQ11 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chsy1Q6ZQ11 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chsy1Q6ZQ11 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chsy1Q6ZQ11 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chsy1Q6ZQ11 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chsy1Q6ZQ11 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chsy1Q6ZQ11 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chsy1Q6ZQ11 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chsy1Q6ZQ11 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chsy1Q6ZQ11 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chsy1Q6ZQ11 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chsy1Q6ZQ11 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chsy1Q6ZQ11 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chsy1Q6ZQ11 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chsy1Q6ZQ11 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chsy1Q6ZQ11 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms