Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LcorQ6ZPI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LcorQ6ZPI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LcorQ6ZPI3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LcorQ6ZPI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LcorQ6ZPI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LcorQ6ZPI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LcorQ6ZPI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorQ6ZPI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorQ6ZPI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LcorQ6ZPI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcorQ6ZPI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LcorQ6ZPI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LcorQ6ZPI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcorQ6ZPI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcorQ6ZPI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcorQ6ZPI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcorQ6ZPI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LcorQ6ZPI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms