Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS2

Ssxb5, MCG68109, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb5Q6XAS2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssxb5Q6XAS2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssxb5Q6XAS2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssxb5Q6XAS2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssxb5Q6XAS2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssxb5Q6XAS2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssxb5Q6XAS2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssxb5Q6XAS2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms