Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc88cQ6VGS5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc88cQ6VGS5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms