Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AY358078Q6UY53 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AY358078Q6UY53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AY358078Q6UY53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AY358078Q6UY53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AY358078Q6UY53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms