Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RimklaQ6PFX8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RimklaQ6PFX8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RimklaQ6PFX8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RimklaQ6PFX8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RimklaQ6PFX8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms