Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFC5

Lrit2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit2Q6PFC5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit2Q6PFC5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrit2Q6PFC5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit2Q6PFC5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit2Q6PFC5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit2Q6PFC5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit2Q6PFC5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit2Q6PFC5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit2Q6PFC5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit2Q6PFC5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit2Q6PFC5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit2Q6PFC5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit2Q6PFC5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms