Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmgb4Q6P8W9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb4Q6P8W9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgb4Q6P8W9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgb4Q6P8W9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmgb4Q6P8W9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmgb4Q6P8W9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmgb4Q6P8W9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmgb4Q6P8W9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmgb4Q6P8W9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgb4Q6P8W9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgb4Q6P8W9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmgb4Q6P8W9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb4Q6P8W9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb4Q6P8W9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb4Q6P8W9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgb4Q6P8W9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms