Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL8

Scube1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube1Q6NZL8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scube1Q6NZL8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scube1Q6NZL8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scube1Q6NZL8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Scube1Q6NZL8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scube1Q6NZL8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scube1Q6NZL8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms