Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn11Q6J756 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn11Q6J756 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn11Q6J756 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn11Q6J756 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn11Q6J756 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Capn11Q6J756 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn11Q6J756 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn11Q6J756 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms