Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nop58Q6DFW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nop58Q6DFW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Nop58Q6DFW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Nop58Q6DFW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Nop58Q6DFW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Nop58Q6DFW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nop58Q6DFW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nop58Q6DFW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nop58Q6DFW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nop58Q6DFW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Nop58Q6DFW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nop58Q6DFW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Nop58Q6DFW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Nop58Q6DFW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Nop58Q6DFW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Nop58Q6DFW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Nop58Q6DFW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Nop58Q6DFW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Nop58Q6DFW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nop58Q6DFW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nop58Q6DFW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nop58Q6DFW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nop58Q6DFW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nop58Q6DFW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms