Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ablim3Q69ZX8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ablim3Q69ZX8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ablim3Q69ZX8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ablim3Q69ZX8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ablim3Q69ZX8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ablim3Q69ZX8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms