Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Jmjd1cQ69ZK6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd1cQ69ZK6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd1cQ69ZK6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms