Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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