Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spa17Q62252 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spa17Q62252 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spa17Q62252 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spa17Q62252 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spa17Q62252 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spa17Q62252 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Spa17Q62252 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spa17Q62252 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spa17Q62252 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms