Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f1Q61501 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f1Q61501 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f1Q61501 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f1Q61501 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2f1Q61501 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2f1Q61501 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f1Q61501 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f1Q61501 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2f1Q61501 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 323.1 ms