Protein–RNA interactions for Protein: Q61096

Prtn3, Myeloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prtn3Q61096 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prtn3Q61096 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prtn3Q61096 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prtn3Q61096 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prtn3Q61096 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prtn3Q61096 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prtn3Q61096 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms