Protein–RNA interactions for Protein: Q60I26

Als2cl, ALS2 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2clQ60I26 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Als2clQ60I26 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Als2clQ60I26 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Als2clQ60I26 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Als2clQ60I26 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Als2clQ60I26 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Als2clQ60I26 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Als2clQ60I26 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Als2clQ60I26 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Als2clQ60I26 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Als2clQ60I26 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2clQ60I26 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2clQ60I26 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms