Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irgm1Q60766 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irgm1Q60766 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irgm1Q60766 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irgm1Q60766 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irgm1Q60766 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irgm1Q60766 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irgm1Q60766 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irgm1Q60766 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irgm1Q60766 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irgm1Q60766 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irgm1Q60766 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irgm1Q60766 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irgm1Q60766 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irgm1Q60766 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irgm1Q60766 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irgm1Q60766 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irgm1Q60766 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms