Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a6Q5U4D8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a6Q5U4D8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a6Q5U4D8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc5a6Q5U4D8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a6Q5U4D8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a6Q5U4D8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a6Q5U4D8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms