Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna2d4Q5RJF7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna2d4Q5RJF7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna2d4Q5RJF7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna2d4Q5RJF7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna2d4Q5RJF7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cacna2d4Q5RJF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna2d4Q5RJF7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms