Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syce1lQ5D525 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1lQ5D525 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1lQ5D525 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1lQ5D525 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syce1lQ5D525 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syce1lQ5D525 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syce1lQ5D525 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syce1lQ5D525 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syce1lQ5D525 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce1lQ5D525 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce1lQ5D525 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syce1lQ5D525 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms