Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam228bQ497Q6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fam228bQ497Q6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fam228bQ497Q6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fam228bQ497Q6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fam228bQ497Q6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fam228bQ497Q6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fam228bQ497Q6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fam228bQ497Q6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Fam228bQ497Q6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fam228bQ497Q6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fam228bQ497Q6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fam228bQ497Q6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fam228bQ497Q6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fam228bQ497Q6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fam228bQ497Q6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fam228bQ497Q6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fam228bQ497Q6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fam228bQ497Q6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fam228bQ497Q6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fam228bQ497Q6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fam228bQ497Q6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fam228bQ497Q6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam228bQ497Q6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam228bQ497Q6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms