Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx25Q3ZT31 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx25Q3ZT31 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx25Q3ZT31 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx25Q3ZT31 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx25Q3ZT31 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx25Q3ZT31 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx25Q3ZT31 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx25Q3ZT31 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx25Q3ZT31 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx25Q3ZT31 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx25Q3ZT31 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx25Q3ZT31 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx25Q3ZT31 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx25Q3ZT31 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms