Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm27235Q3UW50 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm27235Q3UW50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm27235Q3UW50 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm27235Q3UW50 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm27235Q3UW50 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm27235Q3UW50 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm27235Q3UW50 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm27235Q3UW50 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms