Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skap2Q3UND0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skap2Q3UND0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skap2Q3UND0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skap2Q3UND0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skap2Q3UND0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Skap2Q3UND0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skap2Q3UND0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms